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AMCO – La nuova frontiera per la ricerca di biomarcatori

Introduzione

In questi anni abbiamo assistito ad una crescita esponenziale delle tecnologie di spettrometria di massa applicate alla ricerca di biomarcatori che possano essere utili per la diagnosi di patologie. Se da un lato la spettrometria di massa è stata molto utilizzata grazie alle sue notevoli potenzialità, in termini di sensibilità e seletività, dall’altro la mole di dati prodotta è tale da richiedere l’utilizzo di metodiche bioinformatiche notevolmente avanzate. Spesso, quindi ci si trova a dover elaborare i dati con piattaforme simili a quelle utilizzate nel settore genomico (e.g: Microarray). Manca tuttavia un servizio integrato che consenta di unire efficacemente la parte di acquisizione e gestione ed elaborazione dei dati.

Servizio di Biomarker Discovery AMCO

L’innovativa piattaforma AMCO è consente ad ISB di eseguire un servizio unico grazie alla possibilità di unire piattaforme tecnologiche avanzate, basate su tecniche di spettrometria di massa con un sistema elaborativo on-line basato su tecnologia cloud.

Technologie di spettrometria di massa ad alta risoluzione ed accuratezza (QTOF, ORBITRAP).

La ricerca di biomarcatori molecolari, metabolici o proteici, richiede l’ausilio di tecnologie avanzate di spettrometria di massa. Queste ultime devono possedere sia una risoluzione che un accuratezza elevata nella misurazione dei rapporti massa/carica (m/z) dei molecole potenziali biomarcatori. Più elevata è la qualità della misura maggiore sarà la possibilità di rilevare i potenziali biomarcatori di interesse. Per raggiungere detto ambizioso obbiettivo ISB si avvale di una rete di laboratori che possiedono le seguenti tecnologie:

1)  LC-ORBITRAP-MS

2)  FTICR-MS

3)  LC-QTOF-MS

4)  MALDI-TOF-MS

5)  GC-MS

Piattaforma elaborativa cloud

Una volta prodotti i dati di spettrometria di massa essi sono condivisi  con gli utenti mediante l’ausilio di una piattaforma cloud. Quest’ultimo possiede un interfaccia Desktop, accessibile mediante il protocollo di rete Remote Data Protocol (RDP) da diversi dispositivi fissi e mobili (Figura 1).

Figura 1: Schema della rete cloud utile al fine dell’elaborazione, condivisione e centralizzazione dei dati

L’utente accede al sistema cloud e si trova su di una piattaforma informatica ad elevata potenza di calcolo. Su quest’ultima vengono messi a disposizione i software necessari per eseguire in modo accurato tutte le operazioni relative alla visualizzazione ed analisi statistica dei dati. Detto sistema oltre a presentare il vantaggio di essere accessibile da qualsiasi terminale permette di fornire un servizio di assistenza ottimale. E’ infatti possibile chiedere l’assistenza di un operatore di ISB che, in remoto, può fornire risposte accurate ad eventuali problematiche. ISB fornisce anche un servizio aggiuntivo di training qualora il cliente sia interessato ad accrescere le sue competenze nell’utilizzo dei pacchetti software inclusi nella piattaforma.

Contatti

Per maggiori informazioni e chiarimenti si prega di contattare:

ISB srl

Tel: 02.80887134


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